Ninja studoval dlouhou dobu a konečně přišel čas využít své znalosti a dovednosti v Dark Ninja Hanjo. Sensei informoval svého studenta, že je připraven začít samostatný život, ale zároveň byl bývalý student požádán, aby vykonal velmi důležitou misi obnovit město. Mise ukáže, jak je hrdina připraven. Město je pohlceno temnotou, abyste jej osvobodili, budete muset bojovat s démony nebo posedlými válečníky. Ninja bude moci ukázat, čeho je schopen. Přijměte pokyny od učitele v počáteční fázi, bude doprovázet svého studenta, ale pak musíte jednat sami v Dark Ninja Hanjo.