Představte si, že vaše město bylo napadeno mimozemšťany, kteří se snaží zajmout co nejvíce lidí jako vězňů. Vy ve hře Hero Masters budete hrdinou, který se bude muset bránit. Vaše postava bude mít 10 superschopností, které jsou převzaty od nejslavnějších super hrdinů. Jak budete postupovat úrovněmi, budete je moci všechny rozvíjet. Před vámi se na obrazovce objeví ulice, na které se váš hrdina bude nacházet. Pomocí ovládacích kláves budete řídit jeho akce. Budete muset jít vpřed a hledat nepřítele. Jakmile zahlédnete mimozemšťana, zaútočte na něj pomocí jedné ze svých schopností. Zničením nepřítele získáte body. Po nasbírání určitého počtu bodů je můžete utratit za vylepšení kterékoli ze schopností.
