Naruto už dlouho nebyl neklidným teenagerem, který nezná své schopnosti, ale stále je těžké mu říkat moudrý ninja zážitek. Má však tým a jsou připraveni bojovat s temnými silami za právo stát se velkým šinobským vůdcem. Ve fázi hry Ninja Runner Runato můžete pomoci hrdinu porazit další nepřátele, jejichž tok nevyschne. Počet protivníků je velký a hrdina je nastaven na rychlost. Bude běžet rychle a vy ho přimíte reagovat na protijedoucí překážky, a to jak živé, tak neživé.
