Hra Pixel Legyfare Wars začne při výběru regionu, který se shoduje s vaším, protože tato hra je multiplayer. Dále vyberte Určit umístění. Můžete si vybrat z již vytvořených nebo vytvořit vlastní. Počet nepřátel lze také stanovit nezávisle. Vyčistíte umístění ve složení oddělení, ale pokud jste zastřeleni, mise bude selhána. Jakmile jsou provedeny všechny přípravné práce, jděte ven a prozkoumejte místa při hledání cílů ve válkách Pixel Legyfare. Zbraně lze v průběhu času měnit.