Vesmírná přistávací síla v Doom 2D byla vyslána na Mars, kde se nachází komplex vlastněný United Space Corporation. Probíhal tam tajný výzkum Pekla. Laboratoř byla postavena na portálu, který byl kdysi objeven a vědci začali zkoumat jeho a možnosti jeho využití ve prospěch lidstva. Nakonec vše nevyšlo podle plánu. Démoni vylezli z portálu a zaútočili na kolonisty. Parašutista musí získat tajné výzkumné soubory na pevných discích a zachránit ty, kteří zůstanou naživu. Pomozte mu, bude se muset pohybovat po areálu a bojovat s démonickými stvořeními v Doom 2D.
