Rozzlobení pixelatí ptáci létají směrem k vašemu území ve Flappy Crush, ale nemůžete je minout a k tomu potřebujete obratně ovládat dvě trubky, které se po kliknutí na ně spojí. Pokud se mezi ně dostane pták, nepřežije. Ptáci nemají jinou možnost než proletět mezi dvěma trubkami a vy musíte rychle zareagovat a stisknout, aby tudy neproklouzl ani jeden pták. Obtížnost ve Flappy Crush bude postupně narůstat a spočívá v tom, že ptáků přibývá, což znamená vaši rychlejší reakci.