Spider-Manovi se občas dějí neobvyklé věci, zvláště v poslední době. Může jít spát do svého domu a probudit se na úplně jiném místě. To je nějaký druh magie nebo super technologie, musíte to zjistit, než se to zhorší. Ve hře Marvel Ultimate Spider-man Mystery City se vy a super hrdina ocitnete v tajemném městě, které není na mapě. S největší pravděpodobností je v paralelním vesmíru. Spider-Man chce pochopit, jak je ve vesmíru transportován a proč právě zde. Pohybovat se po městě. Je nutné skákat a přistávat přesně na modrých dlaždicích, jinak může být hrdina v Marvel Ultimate Spider-man Mystery City zraněn.
