Ve hře Ninja Monster Killer půjdeme do starověkého Japonska. Ve středověku zde žili lidé, kteří měli magické síly. Někteří z nich využili svou sílu k tomu, aby ublížili lidem. Jeden takový kouzelník, skrze kouzlo a experimenty, shromáždil celou řadu příšer, které bylo ovládáno zvláštním artefaktem. Jeden odvážný ninja byl instruován, aby ukradl předmět. Teď bude muset vstoupit do hradu stojícího na hoře a ukrást objekt. Cesta našeho hrdiny leží na římsách, které vedou na vrchol hory. Budou to monstra. Ovládání hrdiny bude muset skákat přes ně a pokračovat vpřed.