Hra Alien Quarantine se odehrává na území tajné laboratoře, kde se provádějí experimenty na zajatých mimozemských tvorech. Jednomu z mimozemšťanů se podařilo osvobodit, osvobodil ostatní a v laboratoři začal skutečný chaos. Hrdina hry Alien Quarantine je poslán na průzkum, ale čelí nebezpečnému nepříteli. Potřebuje obnovit bezpečnostní systém, aby zabránil monstrům proniknout do jiných sektorů. Chcete-li to provést, musíte aktivovat několik zařízení, pohybovat se a střílet, vyhýbat se útokům mimozemšťanů.
