Poté, co hrdina hry Mr Bullet: Stealth Ninja Killstreak utrpěl příbuzní v důsledku akcí mafiánské skupiny, vydal se na válečnou cestu a rozhodl se pomstít. Pro ninju je to otázka cti. Dokončete úrovně plněním úkolů. Mafiánští bossové na jejich obranu hodí celý svůj arzenál. Před dalším útokem byste se měli zamyslet a vybrat si vhodnější typ zbraně. Ninja už nespoléhá jen na svou šikovnost. Zničení mafie bude vyžadovat serióznější přístup. Hrdina se musí běžet krýt. A pak zamíříte a ninja automaticky vystřelí Mr Bullet: Stealth Ninja Killstreak.
