Bomby jsou vaší zbraní k řešení problémů v Bomb Master 3D. Na každé úrovni musíte zničit budovu vyrobenou z vícebarevných kostek. Navíc je počet bomb přísně omezen. V levém dolním rohu uvidíte jejich sadu. Při míření uvidíte šedou skvrnu – to je místo, kam spadne vaše bomba. Počítejte ale s rázovou vlnou, ta bude trochu větší, takže se kostky zničí. Je nutné dosáhnout úplného zničení bloků. Pokud zbude byť jen jedna, úroveň bude ztracena, ale můžete ji hrát jen tak dlouho, dokud ji nedokončíte v Bomb Master 3D.