Zdá se, že pro ninji ve Flip Ninja neexistuje nic takového jako gravitace. Dokáže vyskočit a následně spadnout se stejnou hbitostí, vždy stojí pevně na obou nohách. Samotné skákání mu proto nedělá problém, ale to, co je ve vesmíru, se stane zkouškou. Ostré shurikeny a další pronikavé a řezné předměty vylétají zleva i zprava. Je potřeba si vybrat okamžik, kdy je cesta volná a teprve potom skočit. Za každý úspěšný skok získáte jeden bod, a pokud se vám podaří uchopit ovoce: červené nebo zelené, získáte ve Flip Ninja tři body najednou.