Statečný samuraj musí projít mnoha zkouškami, aby byl uznán jako hodný svého titulu, ale můžete mu pomoci v Samurai Flash 3D. Hrdina je vyzbrojen dvěma ostrými meči, jsou jako prodloužení jeho rukou. Toto je velmi nebezpečná zbraň v rukou zkušeného válečníka. Nepřátelé ho ale nepotkají jen s meči, ale i se střelnými zbraněmi. Před létajícími kulkami se musíte vyhýbat, některé nepřátele můžete rovnou opustit, protože hlavním úkolem hrdiny je dorazit do cíle. Oponenty musíte zničit, pouze pokud stojí v cestě nebo útočí. Pozor také na neozbrojené, mají těžké pěsti, tak se nepředbíhejte, v Samurai Flash 3D je to zbytečné.
