Mario, námi všemi milovaný instalatér, se začal zajímat o takový pouliční sport, jakým je parkour. Náš hrdina se rozhodl trénovat v tomto sportu na střechách městských budov. Vy v Super Mario City Run se k němu připojíte v tomto tréninku. Před sebou na obrazovce uvidíte Maria stojícího na střeše domu. Pod vaším vedením poběží vpřed a postupně nabírá rychlost. Podívejte se pozorně na obrazovku. Na cestě vašeho hrdiny dojde k selháním oddělujícím střechy budov. Když k jednomu z nich v určité vzdálenosti přiběhne, budete ho muset přimět skočit. Váš hrdina tedy toto nebezpečí přeskočí. Před Mario se také objeví překážky. Na některé z nich bude moci lézt v běhu, pod jiné bude naopak potřebovat zajet na zádech pod dno. Na cestě musí Mario sbírat různé předměty, které vám přinesou body a mohou hrdinovi poskytnout různé druhy bonusů.
