Malé kolonie, kde lidé žijí odděleně a jsou spokojeni s tím, co sami vyprodukují, existují na naší planetě všude. A zpravidla tam nemají rádi cizí lidi. Hrdina hry Colony Escape 2 ale právě takovéto komuny a život v nich studuje, a tak do kolonií vchází bez povolení, dokud není vykázán. N. a tentokrát nechce čekat, až ho vyhodí. Vstoupil na zakázané území, zatímco tam nikdo nebyl a hodlá odejít bez povšimnutí. Vaším úkolem je otevřít všechny dveře a přístup ke všemu v Colony Escape 2