Ve většině stávajících her se ninja před námi jeví jako odvážný obětavý hrdina a bojovník. Statečně bojuje s těmi, kteří přešli na temnou stranu, nebo se skutečnými příšerami a příšerami, obratně rozseká ovoce a zeleninu ostrým mečem a vhodně hodí ocelové hvězdy shuriken. Ve hře Run Ninja potkáte úplně jinou postavu. Ve skutečnosti uvidíte jen jeho záda a jiskřivé podpatky. Náš ninja nechce ovládnout bojové umění, je nad jeho síly a rozhodl se uprchnout z kláštera. Toto je jeho volba a stačí mu pomoci překonat obtížnou cestu, posetou překážkami ve stejných boxech a pastí s hroty v Run Ninja.