Desetiletý Ben se rozhodl navštívit Super Mario v Super Ben 10, ale byl náhle uvězněn. Instalatérovi se nepodařilo hosta potkat a setrvačností odešel na zvláštní místo, kde se testují všichni nově příchozí. Svět Mario není tak jednoduchý a není bezpečný, nemůže v něm být každý. Proto musíte projít testem. Ti, kteří ji neprocházejí, se vracejí domů. Ben měl projít bez zkoušek, ale bohužel, a teď mu musíte pomoci ve hře Super Ben 10, aby jim vyhověl důstojně. Úkolem je shromáždit všechny houby se zelenými čepicemi a teprve poté se objeví východ do další úrovně. V Super Ben 10 je celkem třicet úrovní a pokaždé se zhoršují.
