Šílený profesor Thomas opět provádí experimenty ve své tajné laboratoři. Neúspěšný pokus o smíchání různých chemikálií způsobil výbuch a ve vzduchu se objevily koule naplněné jedovatým plynem. Postupně zaplňují místnost. Ve hře budete muset profesorovi Bubble Shooterovi pomoci vědci se jich zbavit. K tomu náš hrdina použije speciální dělo, které vypálí jednotlivé náboje. Budete muset najít shluk bublin stejné barvy a přes ně uvolnit náboj přesně stejné barvy. Tím je zničíte a získáte za to body.