Každý rok létá Santa Claus na kouzelném jeleni po celém světě a poskytuje dárky. Ale problém je, že náš dobrý dědeček nechal navštívit jiné malé město, ale jeho jelen byl velmi unavený a přistál na straně hory. Náš hrdina se neztratil a když vyskočil na nohy, rozhodl se běžet do města na vlastní nohy. Ty ve hře Pixel Santa Run mu pomůže dostat se včas na místo, které potřebuje. Váš hrdina poběží na určité trase tak rychle, jak umí. Na cestě jeho pohybu vzniknou různé bariéry. Budete muset použít ovládací šipky, aby váš hrdina poběhl po všech těchto nebezpečných částech na silnici.