Při cestování vesmírem objevil astronaut Jack obrovskou unášenou základnu. Náš hrdina se rozhodl proniknout do ní a prozkoumat. Nejprve však bude muset najít přistávací plošinu. Ty ve hře Endless Space Pilot mu s tím pomůže. Budete létat na vaší vesmírné lodi po konkrétní trase. Na vaší cestě narazíte na překážky a různé pasti. Jste chytře manévrování na své lodi, budete muset létat kolem nich všechny strany. Pamatujte, že střety s překážkou způsobí poškození lodi a váš hrdina zemře.