Ben používal omnitriky po dlouhou dobu, bezpečně se reinkarnoval do různých tvorů z jiných planet. To mu pomohlo bojovat s novými hrozbami z vesmíru, mimozemšťany, kteří chtěli zotročit pozemšťany. V poslední době však hodiny začaly selhat, přístroj je založen na míchání DNA a nyní je jeho práce narušena. To je pravděpodobně nějaký neznámý virus. Zatímco hrdina to vyřeší, projde hodně času a nepřítel je již na prahu, musíte bojovat. Musíte přepnout do ručního režimu a budete pomáhat hrdina ve hře Ben 10 Omnitrix Glitch. K tomu, po smíchání molekul, opravit výsledek, a pak jít rozbít nepřítele.
