Ve hře Ben 10: Brains vs Bugs budete muset pomoci legračnímu zelenému mimozemšťanovi osvobodit jeho unesené přátele. Před vámi bude na obrazovce vidět vaše postava, která se bude nacházet na určitém místě. Pomocí ovládacích kláves budete řídit jeho akce. Váš hrdina bude muset jít po určité trase, překonávat různé pasti a další nebezpečí. Na cestě bude sbírat zlaťáky a další užitečné předměty, které vám přinesou body ve hře Ben 10: Brains vs Bugs a mohou postavě dát různé druhy bonusů. Také vaše postava bude muset bojovat s brouky, které na její cestě narazí.