Ve druhé části hry Ninja Dogs 2 budete i nadále pomáhat skupině ninja psů v boji se strážci z království koček. Dnes musíte zaútočit na jejich hrady a zajmout je nebo zničit. Před sebou na obrazovce uvidíte určitou oblast, ve které budou budovy umístěny. Uvnitř budov uvidíte kočky vojáků. V určité vzdálenosti od budov bude instalováno dělo. S jeho pomocí budete střílet na své válečné psy a ti, kteří uletí určitou vzdálenost, narazí do zdi budovy a zničí její útočící kočky. K tomu budete muset vypočítat trajektorie vašich výstřelů. Po zničení všech koček získáte body a přejdete na další úroveň hry.