Ben 10 má velmi vážný problém a jen vy mu ho můžete pomoci vyřešit v Ben 10 Match 3 Puzzle. Faktem je, že hrdina se neobejde bez omnitrixu. Toto zařízení, podobně jako náramkové hodinky, vypadá navenek dostatečně jednoduše, ale vše zajímavé a důležité se skrývá uvnitř. A je zde shromážděno DNA mnoha tvorů, zástupců různých mimozemských ras. Hostitel Omnitrixu se může přeměnit na každého mimozemšťana, jehož DNA je v zařízení. Ale právě teď je to nemožné, protože všechno je smíšené. Pokud začnete zařízení používat, můžete se proměnit ve světem neznámé monstrum. Je nutné uvést věci do pořádku uvnitř zařízení a uděláte to tak, že vytvoříte skupiny tří nebo více stejných a odstraníte je, aby nedošlo k záměně v Ben 10 Match 3 Puzzle.