Každý bojovník v ninjském pořadí musí mít určité bojové dovednosti, dobrou rychlost a agilitu. Proto denně trénují výcvikem. Dnes ve hře Nano Ninja projde také některým z těchto školení. Váš hrdina bude muset běžet na určité cestě od počátečního bodu k cíli. Při signálu se postupně zvedne rychlost. Na své cestě se neustále setkávají s různými překážkami. Použitím ovládacích tlačítek je nutné ho přinutit k běhu nebo k rychlému skoku. Během zadání budete muset také shromáždit různé položky.