Chlapec Thomas chce získat předpověď o tom, co ho čeká v pozdějším životě. Aby to udělal, šel do kouzelného lesa, kde žijí dvě sovy, které dokážou předpovědět. Ale abychom je naši hrdina dostali, bude muset vyřešit hádanku, kterou jim dali ptáci. My ve hře Connect The Gems musíme s tímto hrdinou pomoci našemu hrdinu. Musíte propojit stejné kameny s čárou a pak zmizí z obrazovky. Po získání určitého počtu bodů můžete jít na jinou úroveň, což bude mnohem obtížnější.