Malé arabské město zachytilo velká skupina teroristů. Chtějí nasadit své školicí středisko zde a odtud spáchat své zločiny ve svém vlastním světě. Bez ohledu na to, co se stalo s jejich odstraněním, byla poslána speciální úkolová jednotka k úkolu zničit zločince. Ty ve hře Counter Terrorist Strike se budete moci zúčastnit tohoto boje. Ve hře je na výběr, na které straně budete bojovat. Je-li například vojákem speciálních vojsk, budete muset jako součást oddělení proniknout do ulic města a používat střelné zbraně a výbušniny k ničení teroristů.